长时间处在“正在准备配置windows请勿关闭计算机”状态

目前碰到过两次这种情况，关机时一直处在“正在准备配置windows请勿关闭计算机”的状态，没有进度的提示。有过一次持续了约1小时，还有一次一直没有变化，最终强行关机，之后开机再次出现配置提示，但这次有进度，以正常速度完成之后，进入界面，windows的信息中心提示计算机有待解决问题，内容是检查磁盘。

回忆了一下这两次的共同点是，在关机之前进行了磁盘清理，只是右键点击C盘选择磁盘清理，检查完成之后的清理过程中，一直卡在windows更新的清理，持续很久，于是就取消清理了，之后关机时就遇到了这种情况。

请问会是什么原因导致磁盘清理进行不下去？这跟之后关机过程中卡在准备配置windows有关系么？在这种情况下等待多久是正常的？如果没有反应正确的处理方式是什么？